Каков размер по оси Х, направляющие безопорные, на большой длине, скорее всего, будут прогибаться

Тогда и размер станка можно увеличить, сама по себе модель очень интересная.

Если использовать направляющие с опорой, возможно, отпадет необходимость в использовании двух осей, соответственно двигателей и синхронизации осей.