Установка профилированного рельса.

Точность установки рельс должна быть максимальная, иначе на краях может закусывать, что касаемо люфта, рельсовые подшипники в любом случае имеют микро-люфт, и его не чем не убрать, но так как их будет по 2 штуки, люфт уйдет практически в ноль, для Ваших размеров это не значительно, а что-бы не фрезеровать поверхности, советую ставить на металлический профиль.

Именно металлический а не алюминий, он придаст жесткость Вашему станку, как вариант можете использовать такого плана профиля:

А стол можно и алюминием обшить, любые части которые не подвергаются большой нагрузке можно алюминием.
Что касаемо параллельности, здесь все индивидуально, мы например будем делать так:

1 - Соберем модуль для оси Z
4 - Замерим расстояние (рулеткой) от края до края подшипников.
2,3 - Выставим такое-же расстояние для рельс (начала и конца) - рельсы к профилю не прикручивать а временно закрепить.
Затем наденем модуль Z на рельсы, и будем скользить по оси Y от начала до конца добиваясь того момента, пока скольжение не будет идеальным без закусываний, закрепим направляющие рельсы и продолжим сборку.
У нас призма рельс, с ним прощё снять размеры, есть острые углы.
Как-то так....

Что-бы не искать, кто тебе отфрезерует 2,5 метра трубы, можно подкладывать фальгу, и ничего в этом плохого я не вижу.

Вы хотя бы на листке нарисуйте свой станок,просто что то советовать без рисунка -это что погоду на неделю угадывать.